Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelbQ04863 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RelbQ04863 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RelbQ04863 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RelbQ04863 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelbQ04863 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RelbQ04863 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelbQ04863 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelbQ04863 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelbQ04863 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RelbQ04863 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelbQ04863 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelbQ04863 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelbQ04863 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelbQ04863 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms