Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Gjb2Q00977 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gjb2Q00977 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gjb2Q00977 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb2Q00977 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gjb2Q00977 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gjb2Q00977 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb2Q00977 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Gjb2Q00977 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gjb2Q00977 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gjb2Q00977 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gjb2Q00977 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gjb2Q00977 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjb2Q00977 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb2Q00977 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms