Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thumpd3P97770 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd3P97770 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Thumpd3P97770 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thumpd3P97770 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thumpd3P97770 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thumpd3P97770 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Thumpd3P97770 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Thumpd3P97770 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Thumpd3P97770 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms