Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2cP97760 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2cP97760 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2cP97760 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2cP97760 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2cP97760 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2cP97760 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2cP97760 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2cP97760 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2cP97760 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms