Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LystP97412 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LystP97412 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LystP97412 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LystP97412 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LystP97412 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LystP97412 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LystP97412 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LystP97412 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LystP97412 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LystP97412 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LystP97412 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LystP97412 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LystP97412 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LystP97412 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LystP97412 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LystP97412 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LystP97412 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LystP97412 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LystP97412 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LystP97412 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LystP97412 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LystP97412 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LystP97412 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LystP97412 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LystP97412 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LystP97412 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LystP97412 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LystP97412 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LystP97412 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LystP97412 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LystP97412 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LystP97412 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LystP97412 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LystP97412 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LystP97412 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LystP97412 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LystP97412 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LystP97412 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LystP97412 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LystP97412 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LystP97412 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LystP97412 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LystP97412 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LystP97412 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LystP97412 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LystP97412 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LystP97412 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LystP97412 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LystP97412 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LystP97412 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LystP97412 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LystP97412 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LystP97412 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LystP97412 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LystP97412 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LystP97412 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LystP97412 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LystP97412 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LystP97412 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LystP97412 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LystP97412 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LystP97412 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LystP97412 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LystP97412 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LystP97412 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LystP97412 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LystP97412 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LystP97412 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LystP97412 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LystP97412 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LystP97412 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LystP97412 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LystP97412 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LystP97412 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LystP97412 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LystP97412 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LystP97412 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LystP97412 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LystP97412 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LystP97412 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LystP97412 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LystP97412 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LystP97412 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LystP97412 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LystP97412 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LystP97412 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LystP97412 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LystP97412 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LystP97412 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LystP97412 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LystP97412 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LystP97412 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LystP97412 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LystP97412 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms