Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim43bP86448 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim43bP86448 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim43bP86448 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim43bP86448 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim43bP86448 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim43bP86448 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43bP86448 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43bP86448 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43bP86448 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43bP86448 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43bP86448 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43bP86448 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43bP86448 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms