Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb6P70689 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb6P70689 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb6P70689 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb6P70689 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gjb6P70689 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb6P70689 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb6P70689 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjb6P70689 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb6P70689 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb6P70689 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb6P70689 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb6P70689 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb6P70689 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms