Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprvP70289 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprvP70289 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprvP70289 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprvP70289 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprvP70289 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprvP70289 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprvP70289 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprvP70289 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms