Protein–RNA interactions for Protein: P59158

Slc12a3, Solute carrier family 12 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a3P59158 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a3P59158 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a3P59158 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a3P59158 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc12a3P59158 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a3P59158 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a3P59158 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a3P59158 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a3P59158 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a3P59158 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms