Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms