Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctbp2P56546 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctbp2P56546 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctbp2P56546 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctbp2P56546 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctbp2P56546 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctbp2P56546 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctbp2P56546 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms