Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms