Protein–RNA interactions for Protein: P56135

Atp5j2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5j2P56135 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5j2P56135 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5j2P56135 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5j2P56135 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5j2P56135 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5j2P56135 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5j2P56135 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5j2P56135 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5j2P56135 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5j2P56135 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms