Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dsc2P55292 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dsc2P55292 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dsc2P55292 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsc2P55292 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsc2P55292 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsc2P55292 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsc2P55292 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsc2P55292 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms