Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NcanP55066 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NcanP55066 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NcanP55066 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NcanP55066 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NcanP55066 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NcanP55066 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NcanP55066 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NcanP55066 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NcanP55066 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NcanP55066 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NcanP55066 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NcanP55066 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NcanP55066 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NcanP55066 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NcanP55066 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NcanP55066 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NcanP55066 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NcanP55066 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcanP55066 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcanP55066 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NcanP55066 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NcanP55066 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NcanP55066 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NcanP55066 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NcanP55066 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NcanP55066 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NcanP55066 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NcanP55066 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NcanP55066 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NcanP55066 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NcanP55066 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NcanP55066 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NcanP55066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NcanP55066 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NcanP55066 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NcanP55066 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NcanP55066 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NcanP55066 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NcanP55066 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NcanP55066 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NcanP55066 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcanP55066 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcanP55066 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NcanP55066 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NcanP55066 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NcanP55066 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NcanP55066 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NcanP55066 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NcanP55066 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NcanP55066 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NcanP55066 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NcanP55066 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NcanP55066 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NcanP55066 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NcanP55066 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NcanP55066 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NcanP55066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcanP55066 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcanP55066 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NcanP55066 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NcanP55066 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NcanP55066 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NcanP55066 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NcanP55066 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NcanP55066 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NcanP55066 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NcanP55066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NcanP55066 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NcanP55066 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NcanP55066 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NcanP55066 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NcanP55066 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NcanP55066 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NcanP55066 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NcanP55066 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NcanP55066 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NcanP55066 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NcanP55066 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NcanP55066 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NcanP55066 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NcanP55066 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NcanP55066 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NcanP55066 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NcanP55066 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NcanP55066 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NcanP55066 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NcanP55066 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NcanP55066 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NcanP55066 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NcanP55066 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NcanP55066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NcanP55066 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NcanP55066 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NcanP55066 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NcanP55066 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NcanP55066 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NcanP55066 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NcanP55066 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NcanP55066 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms