Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atxn1P54254 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atxn1P54254 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Atxn1P54254 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn1P54254 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atxn1P54254 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atxn1P54254 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Atxn1P54254 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Atxn1P54254 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Atxn1P54254 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atxn1P54254 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atxn1P54254 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Atxn1P54254 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Atxn1P54254 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Atxn1P54254 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Atxn1P54254 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atxn1P54254 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Atxn1P54254 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Atxn1P54254 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Atxn1P54254 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Atxn1P54254 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Atxn1P54254 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Atxn1P54254 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms