Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Limk1P53668 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Limk1P53668 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Limk1P53668 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Limk1P53668 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Limk1P53668 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Limk1P53668 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limk1P53668 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Limk1P53668 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Limk1P53668 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Limk1P53668 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limk1P53668 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limk1P53668 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk1P53668 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limk1P53668 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Limk1P53668 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limk1P53668 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limk1P53668 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limk1P53668 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limk1P53668 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limk1P53668 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limk1P53668 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limk1P53668 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limk1P53668 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Limk1P53668 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Limk1P53668 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Limk1P53668 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Limk1P53668 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Limk1P53668 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk1P53668 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk1P53668 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limk1P53668 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Limk1P53668 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limk1P53668 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limk1P53668 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limk1P53668 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk1P53668 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limk1P53668 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms