Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd10P28359 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd10P28359 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd10P28359 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd10P28359 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxd10P28359 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxd10P28359 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxd10P28359 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxd10P28359 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hoxd10P28359 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxd10P28359 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxd10P28359 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxd10P28359 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxd10P28359 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxd10P28359 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms