Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pou2f1P25425 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou2f1P25425 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou2f1P25425 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou2f1P25425 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou2f1P25425 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou2f1P25425 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou2f1P25425 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms