Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf2P23906 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf2P23906 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf2P23906 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf2P23906 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf2P23906 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf2P23906 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf2P23906 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf2P23906 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2P23906 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf2P23906 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf2P23906 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf2P23906 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf2P23906 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf2P23906 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf2P23906 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf2P23906 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf2P23906 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf2P23906 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf2P23906 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf2P23906 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf2P23906 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf2P23906 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf2P23906 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf2P23906 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms