Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csn1s1P19228 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csn1s1P19228 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csn1s1P19228 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csn1s1P19228 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csn1s1P19228 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csn1s1P19228 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csn1s1P19228 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csn1s1P19228 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csn1s1P19228 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csn1s1P19228 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csn1s1P19228 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csn1s1P19228 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms