Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
SellP18337 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
SellP18337 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
SellP18337 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
SellP18337 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
SellP18337 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
SellP18337 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
SellP18337 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
SellP18337 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
SellP18337 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
SellP18337 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
SellP18337 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
SellP18337 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
SellP18337 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
SellP18337 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
SellP18337 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
SellP18337 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
SellP18337 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
SellP18337 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
SellP18337 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
SellP18337 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,41■■□□□ 1,02
SellP18337 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,4■■□□□ 1,02
SellP18337 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
SellP18337 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
SellP18337 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
SellP18337 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
SellP18337 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
SellP18337 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
SellP18337 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
SellP18337 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
SellP18337 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,36■■□□□ 1,01
SellP18337 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21,36■■□□□ 1,01
SellP18337 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,34■■□□□ 1,01
SellP18337 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
SellP18337 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
SellP18337 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
SellP18337 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
SellP18337 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
SellP18337 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
SellP18337 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
SellP18337 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
SellP18337 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,3■■□□□ 1
SellP18337 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
SellP18337 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
SellP18337 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
SellP18337 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
SellP18337 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
SellP18337 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
SellP18337 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
SellP18337 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
SellP18337 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
SellP18337 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
SellP18337 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
SellP18337 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
SellP18337 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
SellP18337 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
SellP18337 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
SellP18337 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
SellP18337 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
SellP18337 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
SellP18337 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
SellP18337 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
SellP18337 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
SellP18337 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
SellP18337 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
SellP18337 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
SellP18337 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
SellP18337 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
SellP18337 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
SellP18337 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
SellP18337 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
SellP18337 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
SellP18337 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,15■□□□□ 0,98
SellP18337 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
SellP18337 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
SellP18337 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
SellP18337 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
SellP18337 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
SellP18337 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
SellP18337 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
SellP18337 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
SellP18337 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
SellP18337 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
SellP18337 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
SellP18337 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
SellP18337 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
SellP18337 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
SellP18337 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
SellP18337 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
SellP18337 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms