Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd48P18181 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd48P18181 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd48P18181 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd48P18181 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd48P18181 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd48P18181 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd48P18181 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd48P18181 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd48P18181 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd48P18181 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms