Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb8P09632 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hoxb8P09632 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxb8P09632 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxb8P09632 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxb8P09632 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxb8P09632 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxb8P09632 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxb8P09632 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxb8P09632 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxb8P09632 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxb8P09632 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxb8P09632 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxb8P09632 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxb8P09632 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb8P09632 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms