Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtrP07309 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtrP07309 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtrP07309 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtrP07309 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtrP07309 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TtrP07309 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TtrP07309 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TtrP07309 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtrP07309 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TtrP07309 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TtrP07309 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtrP07309 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TtrP07309 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtrP07309 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TtrP07309 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtrP07309 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtrP07309 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TtrP07309 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtrP07309 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TtrP07309 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtrP07309 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TtrP07309 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtrP07309 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TtrP07309 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtrP07309 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtrP07309 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtrP07309 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtrP07309 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtrP07309 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtrP07309 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtrP07309 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtrP07309 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtrP07309 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtrP07309 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtrP07309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtrP07309 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtrP07309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtrP07309 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtrP07309 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtrP07309 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtrP07309 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtrP07309 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtrP07309 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtrP07309 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtrP07309 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtrP07309 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TtrP07309 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtrP07309 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtrP07309 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TtrP07309 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TtrP07309 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TtrP07309 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TtrP07309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtrP07309 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtrP07309 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtrP07309 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TtrP07309 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TtrP07309 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TtrP07309 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TtrP07309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TtrP07309 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TtrP07309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtrP07309 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtrP07309 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TtrP07309 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtrP07309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TtrP07309 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TtrP07309 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TtrP07309 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtrP07309 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtrP07309 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtrP07309 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TtrP07309 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtrP07309 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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