Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgamP05555 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgamP05555 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgamP05555 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ItgamP05555 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ItgamP05555 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgamP05555 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgamP05555 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgamP05555 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgamP05555 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms