Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-K1P01901 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-K1P01901 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-K1P01901 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-K1P01901 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-K1P01901 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2-K1P01901 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-K1P01901 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-K1P01901 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms