Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnkO88874 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CcnkO88874 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcnkO88874 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnkO88874 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcnkO88874 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcnkO88874 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CcnkO88874 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnkO88874 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcnkO88874 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnkO88874 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms