Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctnnal1O88327 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctnnal1O88327 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctnnal1O88327 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctnnal1O88327 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctnnal1O88327 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnnal1O88327 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnnal1O88327 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctnnal1O88327 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnal1O88327 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ctnnal1O88327 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms