Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Lnx1O70263 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Lnx1O70263 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Lnx1O70263 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Lnx1O70263 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lnx1O70263 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Lnx1O70263 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Lnx1O70263 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Lnx1O70263 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lnx1O70263 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lnx1O70263 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Lnx1O70263 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms