Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtogO55225 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OtogO55225 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtogO55225 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtogO55225 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtogO55225 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtogO55225 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtogO55225 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtogO55225 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtogO55225 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtogO55225 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OtogO55225 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OtogO55225 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtogO55225 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OtogO55225 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OtogO55225 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtogO55225 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OtogO55225 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtogO55225 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OtogO55225 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtogO55225 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtogO55225 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtogO55225 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtogO55225 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtogO55225 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtogO55225 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtogO55225 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtogO55225 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtogO55225 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtogO55225 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtogO55225 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OtogO55225 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OtogO55225 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtogO55225 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtogO55225 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtogO55225 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtogO55225 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtogO55225 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtogO55225 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtogO55225 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtogO55225 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtogO55225 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtogO55225 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtogO55225 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtogO55225 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
OtogO55225 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtogO55225 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OtogO55225 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtogO55225 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtogO55225 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtogO55225 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtogO55225 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtogO55225 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtogO55225 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtogO55225 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtogO55225 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtogO55225 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtogO55225 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtogO55225 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtogO55225 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtogO55225 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OtogO55225 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OtogO55225 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtogO55225 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtogO55225 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtogO55225 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtogO55225 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtogO55225 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtogO55225 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtogO55225 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtogO55225 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtogO55225 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtogO55225 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OtogO55225 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtogO55225 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtogO55225 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtogO55225 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtogO55225 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtogO55225 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtogO55225 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtogO55225 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtogO55225 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtogO55225 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtogO55225 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtogO55225 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtogO55225 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtogO55225 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtogO55225 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtogO55225 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtogO55225 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtogO55225 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtogO55225 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtogO55225 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtogO55225 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms