Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlx3O55144 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlx3O55144 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlx3O55144 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlx3O55144 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlx3O55144 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlx3O55144 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlx3O55144 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlx3O55144 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlx3O55144 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx3O55144 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlx3O55144 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlx3O55144 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlx3O55144 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlx3O55144 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms