Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff2O55112 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff2O55112 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff2O55112 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff2O55112 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff2O55112 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff2O55112 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff2O55112 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aff2O55112 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff2O55112 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff2O55112 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff2O55112 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff2O55112 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff2O55112 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff2O55112 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff2O55112 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Aff2O55112 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aff2O55112 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aff2O55112 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aff2O55112 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aff2O55112 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aff2O55112 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aff2O55112 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms