Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc3O55013 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc3O55013 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trappc3O55013 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3O55013 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc3O55013 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc3O55013 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trappc3O55013 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trappc3O55013 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms