Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Atp10aO54827 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Atp10aO54827 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Atp10aO54827 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,61■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,59■■■■□ 3,77
Atp10aO54827 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38,54■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,51■■■■□ 3,76
Atp10aO54827 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Atp10aO54827 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,48■■■■□ 3,75
Atp10aO54827 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Atp10aO54827 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Atp10aO54827 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Atp10aO54827 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Atp10aO54827 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,39■■■■□ 3,74
Atp10aO54827 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,38■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,37■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,33■■■■□ 3,73
Atp10aO54827 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Atp10aO54827 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Atp10aO54827 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38,29■■■■□ 3,72
Atp10aO54827 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,23■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38,22■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38,22■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Atp10aO54827 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Atp10aO54827 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Atp10aO54827 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Atp10aO54827 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Atp10aO54827 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Atp10aO54827 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Atp10aO54827 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Atp10aO54827 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,99■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,98■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Atp10aO54827 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Atp10aO54827 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Atp10aO54827 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,81■■■■□ 3,64
Atp10aO54827 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Atp10aO54827 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Atp10aO54827 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Atp10aO54827 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Atp10aO54827 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Atp10aO54827 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Atp10aO54827 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Atp10aO54827 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Atp10aO54827 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Atp10aO54827 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms