Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FxnO35943 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FxnO35943 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FxnO35943 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FxnO35943 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FxnO35943 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FxnO35943 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FxnO35943 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FxnO35943 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FxnO35943 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FxnO35943 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FxnO35943 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FxnO35943 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FxnO35943 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
FxnO35943 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FxnO35943 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FxnO35943 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FxnO35943 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FxnO35943 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FxnO35943 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FxnO35943 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FxnO35943 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FxnO35943 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FxnO35943 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FxnO35943 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FxnO35943 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FxnO35943 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FxnO35943 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FxnO35943 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FxnO35943 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FxnO35943 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FxnO35943 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FxnO35943 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FxnO35943 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FxnO35943 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FxnO35943 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FxnO35943 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FxnO35943 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FxnO35943 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FxnO35943 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FxnO35943 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FxnO35943 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FxnO35943 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FxnO35943 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FxnO35943 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FxnO35943 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FxnO35943 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FxnO35943 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FxnO35943 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FxnO35943 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FxnO35943 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FxnO35943 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FxnO35943 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FxnO35943 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FxnO35943 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FxnO35943 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FxnO35943 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FxnO35943 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FxnO35943 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FxnO35943 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FxnO35943 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FxnO35943 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FxnO35943 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FxnO35943 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FxnO35943 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FxnO35943 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FxnO35943 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FxnO35943 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FxnO35943 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FxnO35943 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FxnO35943 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FxnO35943 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FxnO35943 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FxnO35943 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FxnO35943 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FxnO35943 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FxnO35943 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FxnO35943 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FxnO35943 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FxnO35943 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FxnO35943 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FxnO35943 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FxnO35943 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FxnO35943 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FxnO35943 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FxnO35943 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FxnO35943 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FxnO35943 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FxnO35943 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FxnO35943 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FxnO35943 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FxnO35943 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FxnO35943 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FxnO35943 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FxnO35943 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms