Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
C1dO35473 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
C1dO35473 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
C1dO35473 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
C1dO35473 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
C1dO35473 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
C1dO35473 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
C1dO35473 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
C1dO35473 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
C1dO35473 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
C1dO35473 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
C1dO35473 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
C1dO35473 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
C1dO35473 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
C1dO35473 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
C1dO35473 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
C1dO35473 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
C1dO35473 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
C1dO35473 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
C1dO35473 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
C1dO35473 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
C1dO35473 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
C1dO35473 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
C1dO35473 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
C1dO35473 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
C1dO35473 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
C1dO35473 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
C1dO35473 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
C1dO35473 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
C1dO35473 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,29
C1dO35473 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,29
C1dO35473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
C1dO35473 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
C1dO35473 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
C1dO35473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
C1dO35473 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
C1dO35473 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
C1dO35473 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
C1dO35473 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
C1dO35473 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
C1dO35473 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
C1dO35473 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
C1dO35473 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
C1dO35473 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
C1dO35473 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
C1dO35473 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23■■□□□ 1,27
C1dO35473 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
C1dO35473 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
C1dO35473 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
C1dO35473 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
C1dO35473 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
C1dO35473 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
C1dO35473 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
C1dO35473 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
C1dO35473 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
C1dO35473 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
C1dO35473 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
C1dO35473 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
C1dO35473 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
C1dO35473 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
C1dO35473 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
C1dO35473 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
C1dO35473 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,9■■□□□ 1,26
C1dO35473 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
C1dO35473 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
C1dO35473 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
C1dO35473 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
C1dO35473 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
C1dO35473 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
C1dO35473 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
C1dO35473 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
C1dO35473 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
C1dO35473 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
C1dO35473 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
C1dO35473 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
C1dO35473 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
C1dO35473 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
C1dO35473 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,8■■□□□ 1,24
C1dO35473 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
C1dO35473 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
C1dO35473 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
C1dO35473 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
C1dO35473 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
C1dO35473 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
C1dO35473 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
C1dO35473 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
C1dO35473 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
C1dO35473 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
C1dO35473 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
C1dO35473 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
C1dO35473 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
C1dO35473 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,74■■□□□ 1,23
C1dO35473 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
C1dO35473 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
C1dO35473 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,72■■□□□ 1,23
C1dO35473 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
C1dO35473 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
C1dO35473 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
C1dO35473 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
C1dO35473 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms