Protein–RNA interactions for Protein: O35368

Ifi203, Interferon-activable protein 203, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi203O35368 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifi203O35368 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi203O35368 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifi203O35368 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifi203O35368 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifi203O35368 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi203O35368 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi203O35368 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms