Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
PrkcshO08795 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PrkcshO08795 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PrkcshO08795 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PrkcshO08795 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
PrkcshO08795 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
PrkcshO08795 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PrkcshO08795 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PrkcshO08795 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
PrkcshO08795 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
PrkcshO08795 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
PrkcshO08795 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
PrkcshO08795 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
PrkcshO08795 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
PrkcshO08795 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
PrkcshO08795 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29,2■■■□□ 2,27
PrkcshO08795 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
PrkcshO08795 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
PrkcshO08795 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms