Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klf6O08584 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klf6O08584 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf6O08584 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Klf6O08584 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klf6O08584 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf6O08584 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klf6O08584 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Klf6O08584 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf6O08584 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf6O08584 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf6O08584 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf6O08584 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf6O08584 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf6O08584 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klf6O08584 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klf6O08584 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klf6O08584 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klf6O08584 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klf6O08584 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms