Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mfsd4b4J3QNS5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd4b4J3QNS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd4b4J3QNS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd4b4J3QNS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4b4J3QNS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd4b4J3QNS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd4b4J3QNS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd4b4J3QNS5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mfsd4b4J3QNS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms