Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srp72F8VQC1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp72F8VQC1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp72F8VQC1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srp72F8VQC1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp72F8VQC1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp72F8VQC1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srp72F8VQC1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms