Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga10E9Q6R1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga10E9Q6R1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga10E9Q6R1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga10E9Q6R1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga10E9Q6R1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga10E9Q6R1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga10E9Q6R1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga10E9Q6R1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itga10E9Q6R1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga10E9Q6R1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga10E9Q6R1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga10E9Q6R1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms