Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39,5■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,48■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39,47■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39,47■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39,46■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Fndc1E9Q043 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,44■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,42■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Fndc1E9Q043 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Fndc1E9Q043 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Fndc1E9Q043 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Fndc1E9Q043 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,89
Fndc1E9Q043 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Fndc1E9Q043 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39,25■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Fndc1E9Q043 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39,17■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39,15■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Fndc1E9Q043 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Fndc1E9Q043 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39,06■■■■□ 3,84
Fndc1E9Q043 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Fndc1E9Q043 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Fndc1E9Q043 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Fndc1E9Q043 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38,99■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Fndc1E9Q043 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38,92■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Fndc1E9Q043 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Fndc1E9Q043 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Fndc1E9Q043 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Fndc1E9Q043 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Fndc1E9Q043 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Fndc1E9Q043 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,64■■■■□ 3,78
Fndc1E9Q043 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38,64■■■■□ 3,78
Fndc1E9Q043 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38,63■■■■□ 3,78
Fndc1E9Q043 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Fndc1E9Q043 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Fndc1E9Q043 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms