Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dchs1E9PVD3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dchs1E9PVD3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dchs1E9PVD3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dchs1E9PVD3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dchs1E9PVD3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dchs1E9PVD3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dchs1E9PVD3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dchs1E9PVD3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dchs1E9PVD3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dchs1E9PVD3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dchs1E9PVD3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dchs1E9PVD3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dchs1E9PVD3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dchs1E9PVD3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dchs1E9PVD3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dchs1E9PVD3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms