Protein–RNA interactions for Protein: E9PV87

Talpid3, Protein TALPID3, mousemouse

Predictions only

Length 1,520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Talpid3E9PV87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Talpid3E9PV87 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Talpid3E9PV87 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Talpid3E9PV87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Talpid3E9PV87 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Talpid3E9PV87 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Talpid3E9PV87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Talpid3E9PV87 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Talpid3E9PV87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Talpid3E9PV87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Talpid3E9PV87 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Talpid3E9PV87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Talpid3E9PV87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Talpid3E9PV87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Talpid3E9PV87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Talpid3E9PV87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Talpid3E9PV87 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Talpid3E9PV87 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Talpid3E9PV87 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Talpid3E9PV87 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Talpid3E9PV87 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Talpid3E9PV87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Talpid3E9PV87 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Talpid3E9PV87 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Talpid3E9PV87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Talpid3E9PV87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Talpid3E9PV87 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Talpid3E9PV87 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Talpid3E9PV87 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Talpid3E9PV87 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Talpid3E9PV87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Talpid3E9PV87 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Talpid3E9PV87 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Talpid3E9PV87 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Talpid3E9PV87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms