Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd17E0CYQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd17E0CYQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd17E0CYQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd17E0CYQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kctd17E0CYQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd17E0CYQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd17E0CYQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd17E0CYQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kctd17E0CYQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kctd17E0CYQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kctd17E0CYQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms