Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28043E0CXC2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28043E0CXC2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm28043E0CXC2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28043E0CXC2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28043E0CXC2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28043E0CXC2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28043E0CXC2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28043E0CXC2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms