Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Samd1D3YXK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samd1D3YXK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samd1D3YXK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Samd1D3YXK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd1D3YXK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd1D3YXK1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd1D3YXK1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd1D3YXK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samd1D3YXK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms