Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm7257D3YX25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm7257D3YX25 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm7257D3YX25 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7257D3YX25 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm7257D3YX25 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm7257D3YX25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms